审计处当前科室设置为：

1. 财务审计科：对除工程建设外涉及财务的事项进行审计；进行科研项目审计；配合综合审计科进行经济责任审计。

2. 工程审计科：对所有建设工程项目进行审计。

3. 综合审计科：对内部控制、重大事项、干部经济责任等各项管理事项进行审计。